当前，小微企业发展面临的突出问题和重要瓶颈，是融资难和融资成本不断攀升。在我国，除了在高新区的小微企业能获得较多的金融创新政策支持外，普遍小微企业存在融资渠道狭窄、融资量少、融资困难等问题，主要表现在：
内部融资不足。目前，大多数小微企业发展的资金主要靠自身的积累，内部融资是小微企业融资的主要渠道，但受到利润率和积累期限的限制，其融资的能力相当有限。根据统计，我国私营企业资本金来源的26%是依靠内部留存收益积累的资金，其中小微企业这一比例更高。
通过金融机构融资难。根据全国工商联调查显示，规模以下的小企业90%没有与金融机构发生任何借贷关系，小微企业95%没有与金融机构发生任何借贷关系。通过调研走访了解，有64%的受调查企业认为，制约企业发展的主要因素是“资金匮乏”，有66%的受调查企业迫切需要解决融资难问题。
小微企业融资难，究其成因，主要有：信贷资源不足。一方面，去年以来，受国家宏观调控政策影响，央行对金融机构信贷规模控制实行按月调控，银行总体信贷规模受限，可供小微企业使用的信贷额度更是紧张。另一方面，受法定存款准备金提高影响，农村金融机构存款压力倍增，受存贷比限制，贷款额度更是捉襟见肘。此外，农村中小金融机构经历多年高速发展，普遍受资本金约束，风险资产不足，这导致难以支持小微企业。
经营风险较大，资金需求“短、频、急”。由于小微企业规模较小、实物资产较少、技术水平不高 ，其发展极易受到经营环境的影响，抗风险能力较弱，影响小微企业自身的资金积累和信贷融资。此外，小微企业贷款主要是满足流动资金需求，贷款需求较急、频率较高且资金需求一次性量较少，融资的复杂性使其融资成本较高，管理成本较高。
抵押物缺乏。小微企业通常规模小、资产少，特别是大量分布在第一和第三产业的小企业，几乎很难找到较为不易贬值的抵押物，这使得银行很难控制信用风险，在资本充足率监管加强、银行希望贷款能够有更多风险缓释手段的情况下，问题就会变得更加严重。据调查，80%以上的小微企业抵押物不足或没有抵押物。
道德风险问题突出。银行及其他投资者与小微企业间存在严重的信息不对称，导致逆向选择和道德风险，信贷风险较高。大多数小微企业财务状况的透明度不高，内部的监督制衡机制不够完善，财务制度也不够规范，搬迁相对容易，这使得银行在尽职调查时很难获得充分有效的信息。使得金融机构和投资者无从正确地判断小微企业的经营状况和财务风险。同时，银行为加强风险管理，降低贷款风险容忍度，推行严格的责任追究。这种趋利避害的信贷管理机制，迫使贷款发放人会放弃小微企业，对小微企业噤若寒蝉。
小微企业抗风险能力差。相对大企业，小微企业生命周期较短，小企业的破产率更高，风险更大。研究结果显示，一般小企业创办5年内的死亡率高达30%至50%。据调查统计，四川小微企业生命周期2年左右，而全国平均在3年以上。因此，很多银行金融机构对小微企业不敢大胆投放贷款。
